Eurofarma tiene el objetivo de mejorar procesos en conformidad con las certificaciones reconocidas y exigidas por el mercado internacional. La empresa conquistó la ISO 9001, versión 2000, y ahora continua en la mejora del Sistema de Calidad. Otra meta consolidada, en 2006, fue la obtención de la certificación ISO 14001. El objetivo de la empresa, abarca también las certificaciones específicas de su mercado de actuación. La estructura tecnológica y de personal debidamente capacitado hizo posible que la empresa ingresase en la Red Brasileña de Laboratorios Analíticos de Salud (Reblas), que certificó a Eurofarma como entidad oficial autorizada por la Anvisa para realizar pruebas de equivalencia farmacéutica. En todos los segmentos industriales en donde actúa, la empresa mantiene un rígido cumplimiento de las normas de GMP, basadas en las reglamentaciones vigentes en el país, establecidas y fiscalizadas por la Anvisa. Pero Eurofarma también se prepara para alcanzar la certificación de órganos internacionales, como FDA.